显微镜下的蓝藻。
当河流中的藻类数量快速增长和死亡时，这种“藻类大量繁殖”的现象会对当地的野生动物、生态系统和人类造成毁灭性的打击。
显微镜下的蓝藻是地球生命的基础。这些微小的植物提供驱动海洋和淡水食物网的燃料，通过光合作用，它们吸收二氧化碳帮助抵消排放，并为我们提供氧呼吸。除了河流、小溪、湖泊、河口和海岸，它们还可以在多样的环境如雪、土壤和珊瑚。
但是当人类将农业径流、污水和雨水排放到水道中时，我们会显著增加氮和磷等营养物质的含量。这就造成了一种不平衡，因为一些微小的藻类在吸收营养方面非常有效，并且生长非常快，一天分裂一次，很快就超过了其他物种。结果是藻类大量繁殖。
那么，为什么我们不一直都有藻华呢？这是因为藻类不仅仅需要营养才能生长。像任何植物一样，温度和光照等因素也是决定藻类生长速度和是否形成水华的重要因素。花朵也需要缓慢移动或静止的水来建立。
藻华通常出现在淡水中。造成这种现象的主要藻类是蓝绿藻，或者更准确地说是蓝细菌。在我们的水库、湖泊和缓慢流动的河流中，它们经常在温暖的天气里开花。
它们对环境和经济有许多影响。一些藻华是有毒的，需要昂贵的水处理，在极端情况下，还需要停止供水。
毒素也能影响家畜，如狗，当它们饮用受污染的水时，并限制使用湖泊和河流游泳、划船和捕鱼。即使藻华无毒，它们也会破坏食物网，减少动植物物种的数量。
他们也可以减少氧气水平晚上，当它们从白天的光合作用(产生氧气)转换到一个叫做呼吸在他们使用氧气的晚上。低氧会造成压力，甚至会杀死鱼和其他动物，如果它们无法逃脱的话。
在某种程度上，当条件变得不合适时，藻华就会崩溃。最终死亡的藻类分解，为细菌提供了理想的食物来源。这是水变臭的时候，通常有臭鸡蛋的味道。随着细菌的繁殖，它们从水中吸取氧气。在这一点上，氧气水平变得日夜都很低。
如果低氧区范围很广，例如整个湖泊或几公里长的河流系统，鱼类和其他动物可能无法逃到更合适的含氧量，而且通常会发生重大鱼类死亡。
在世界其他地区，藻类大量繁殖造成了如此恶劣的氧气条件，以至于现在全世界数千平方公里的海洋被称为死区那里没有动物可以生存。
蓝藻产生的原因：受其它藻种的生长制约，蓝藻并不可能在常温条件下大规模暴发，水温25—35℃时，蓝藻的生长速度才会比其他藻类快，故温度是蓝藻暴发的主要因素之一。养殖水体中富营养化，蓝藻比较容易生长，所以不经常换水的池塘往往更容易暴发蓝藻。有机磷是蓝藻生长的必须因素。另外，治理蓝藻最直接最根本的办法就是除去有机磷。
温度是蓝藻暴发的主要因素之一。养殖水体中富营养化，蓝藻比较容易生长，所以不经常换水的池塘往往更容易暴发蓝藻。
有机磷是蓝藻生长的必须因素，治理蓝藻最直接最根本的办法就是除去有机磷。蓝藻暴发的成因为富营养化。
蓝藻是最早的光合放氧生物，对地球表面从无氧的大气环境变为有氧环境起了巨大的作用。有不少蓝藻可以直接固定大气中的氮，以提高土壤肥力，使作物增产。还有的蓝藻为人们的食品，如著名的发菜和普通念珠藻、螺旋藻等。
蓝藻植物体有单细胞的、群体的和丝状体(filament)的， 是原核生物，没有染色质，但存在环状DNA——质粒。
蓝藻(Cyanobacteria)和具原核的细菌等一起，单立为原核生物界。所有的蓝藻都含有一种特殊的蓝色色素，蓝藻就是因此得名。
但是蓝藻也不全是蓝色的，不同的蓝藻含有不同的色素，有的含叶绿素，有的含有蓝藻叶黄素，有的含有胡萝卜素，有的含有蓝藻藻蓝素，也有的含有蓝藻藻红素。红海就是由于水中含有大量藻红素的蓝藻，使海水呈现出红色。蓝藻是单细胞原核生物，又叫蓝细菌、蓝绿菌、蓝藻或蓝绿藻，或称为蓝菌门。
虽然传统上归于藻类，但有研究发现因为没有核膜等等，与细菌非常接近，因此现时已被归入细菌域。蓝藻并不是绿藻。蓝藻是一类藻类的统称，其标志便是单细胞、没有以核膜为界限的细胞核(真核)。常见的蓝藻有蓝球藻(色球藻)、念珠藻、颤藻、发菜等。蓝藻都为单细胞生物，以细胞群形式出现时才容易看见，也就是我们通常见到的“水华”。衣藻属于绿藻，真核生物，不同于蓝藻。
蓝藻爆发的原因主要有：
1. 化肥流失，化肥是很多富营养化区域的主要养分来源，例如在密西西比河流域，67%的氮流入水体，随之流入墨西哥湾，波罗的海和太湖中超过50%的氮也来自化肥的流失。
2. 生活污水，包括人类的生活废水和含磷清洁剂。
3. 畜禽养殖，畜禽的粪便含有大量营养废物如氮和磷，这些元素都能导致富营养化。
4. 工业污染，包括化肥厂和废水排放。
5. 燃烧矿物燃料，在波罗的海中约30%的氮，在密西西比河中约13%的氮来源于此。
6.蓝藻使水体缺氧，使动物死亡，分解者分解是又消耗氧气，造成恶性循环。
受其它藻种的生长制约，蓝藻并不可能在常温条件下大规模暴发，水温25—35℃时，蓝藻的生长速度才会比其他藻类快，故温度是蓝藻暴发的主要因素之一。养殖水体中富营养化，蓝藻比较容易生长，所以不经常换水的池塘往往更容易暴发蓝藻。有机磷是蓝藻生长的必须因素，治理蓝藻最直接最根本的办法就是除去有机磷。
